Het is een duistere tijd in Gotham City. De stad wordt gegijzeld door de machtige en misdadige Falcone-familie, en het wemelt er van de criminaliteit en corruptie. Daar komt de mysterieuze Holiday killer nog bij, die zich richt op de onderwereld en een spoor van terreur en lijkzakken achterlaat. Batman, Lieutenant Gordon en D.A. Harvey Dent racen tegen de klok naarmate de volgende rampzalige feestdag dichterbij komt. De film is gebaseerd op het bekroonde beeldverhaal Batman: The Long Halloween, Part One, waarin de Dark Knight door een verwrongen reeks gebeurtenissen voorgoed verandert.