”חיות הפלא והיכן למצוא אותן“ מתחיל בשנת 1926, לאחר שניוט סקמנדר השלים סיור ברחבי העולם בניסיון למצוא ולתעד שורה מדהימה של יצורים קסומים. ניוט מגיע לחניית ביניים בניו יורק, והוא יכול היה להגיע ולהמשיך בדרכו מבלי שיקרה דבר... אלמלא מוגל בשם ג'ייקוב, תיבת כישוף שאבדה ובריחת חלק מחיות הפלא של ניוט, אירועים העלולים לגרום לצרות הן בעולם הקוסמים והן בעולם של המוגלים.