Seconda Guerra Mondiale. Berlino è il centro politico del conflitto che sta travolgendo il mondo. I suoi abitanti sono vittime di bombardamenti e gli ebrei berlinesi vivono il dramma delle deportazioni. Un gruppo di giovani ebrei, composto da quattro adolescenti, riesce a nascondersi in un appartamento, sottraendosi alle retate. Ciascuno di loro lavora al boicottaggio del sistema nazista, partecipando ad una forma di resistenza segreta e inarrestabile. "Gli Invisibili" è ispirato ad una storia vera: i giovani sono sopravvissuti al conflitto e raccontano nel film le atrocità vissute personalmente.