A történet a Monarch kripto-zoológus ügynökség hősi erőfeszítéseit követi nyomon, mikor tagjai szembeszállnak több titáni méretű szörnyeteggel. A szörnyek sorát gyarapítja Gozdilla, aki Mothrával és Rodannal ütközik meg, továbbá ősellensége, a háromfejű Ghidorah. A szuperlények, akiknek létezését eddig csak mítosznak tartották, felemelkednek, és összecsapnak a világ feletti uralomért, veszélybe sodorva az emberi faj fennmaradását is.