Alle vet at Marnie Piper er en heks nå, så ingen blir overrasket når hun vinner et fullt stipend til det prestisjetunge Witch University i Halloweentown. Marnie gleder seg til å lære om alkymi og amuletter, men skolen har en ny regel: Ingen magi er tillatt! Hun finner også ut at ifølge en gammel spådom har hun nøkkelen til å avsløre den største hemmeligheten.