Nakon godina skrivanja od ljudskog sveta, braća Kornjače su krenuli da osvoje srca Njujorčana i da kroz herojske postupke budu prihvaćeni kao normalni tinejdžeri. Njihova nova prijateljica April O’Neil pomaže im da se izbore sa misterioznim kriminalnim sindikatom, ali ubrzo upadaju u problem kada vojska mutanata kreće na njih.