Ash la sa lunga sui Pokémon, ma sarà pronto ad affrontare il misterioso Darkrai in questa fantastica avventura? In viaggio verso il prossimo torneo, i nostri eroi attraversano la città di Alamos, che ospita le Torri Spazio-Tempo. Ash e i suoi amici scoprono che qualcosa sta causando dei terribili incubi ai Pokémon e alle persone. L'arrogante Barone Alberto è convinto che sia opera di Darkrai, che appare all'improvviso e affronta i nostri eroi. Chi è Darkrai? Un amico... o un nemico? Intanto si apre un varco nel cielo di Alamos dal quale appaiono i Pokémon leggendari Dialga e Palkia... Il loro scontro minaccia di lacerare il continuum spazio-temporale! Riusciranno Ash e i suoi amici a sopravvivere allo scontro e a scoprire la vera natura di Darkrai?