Na maior aventura de sempre de Scooby-Doo, descobre a história inédita de como os amigos, Scooby e Shaggy, se conheceram e como se uniram a Fred, Velma e Daphne para criarem a famosa Mystery Inc. Agora, com centenas de casos resolvidos, Scooby e o bando enfrentam o seu maior mistério de sempre: um plano para libertar Cerberus, o cão fantasma. Enquanto correm contra o tempo para impedir este "cãopocalipse" global, o bando descobre que Scooby tem um legado secreto e um destino épico que ninguém imaginava.