Scooby-Doo og Shaggys yndlingstid er over os! Falske monstre og slik i massevis gør halloween til en tur i himlen for de sultne slikmunde. Men i år bliver deres søde helligdage ødelagt, da nabolagets græskarmark inficeres af giftigt snask og fyldes af flyvende græskarlygter og en enorm græskarboss, der smadrer alt på sin vej. Nu er det op til Scooby-Doo og banden samt deres venner, Bill Nye The Science Guy og Elvira Mistress of the Dark, at løse dette mysterie af gigantiske proportioner og redde Crystal Cove!