La trilogia di successo di SPY KIDS ha catturato l'immaginazione delle famiglie di tutto il mondo con le sue avventure scatenate, le bravate divertenti e il suo stile accattivante. In questa prima avventura, le super spie Gregorio (Antonio Banderas) e Ingrid (Carla Gugino) abbandonano le loro vite fatte di intrighi per crescere i figli Carmen (Alexa Vega) e Juni (Daryl Sabara). Ma l'inquietante super cattivo Fegan Floop (Alan Cumming) vuole una delle invenzioni di Gregorio per concretizzare il suo piano per dominare il mondo, e quando rapisce i genitori sta ai ragazzi correre in loro aiuto.