Wanneer een ruimteschip neer plonst in de haven van Gotham, komen Batman en Superman een mysterieuze Kryptoniër tegen met krachten die gelijk zijn aan die van Superman. Wanneer Darkseid dit ontdekt, ontvoert hij de Kryptoniër en brengt hem naar Apokolips. Het is de taak van Batman en Superman om de Kryptoniër terug te halen, waardoor ze gedwongen zijn de vijandelijke wereld van Darkseid te betreden waar overal superkrachtige gevaren dreigen.