Po letih umika pred človeškim svetom se želvji bratje odločijo osvojiti srca Newyorčanov. S pomočjo junaških dejanj želijo biti sprejeti kot normalni najstniki. Nova prijateljica April O'Neil jim pomaga v boju s skrivnostno zločinsko združbo, a zadevi kmalu niso več kos, saj se jih loti vojska mutantov.