Nach dem Ende von Megatron beginnen die Autobots Cybertron wieder aufzubauen, während sich Optimus auf die Suche nach dem Allspark begibt. Gleichzeitig erhebt sich Unicron und bemächtigt sich Megatrons leblosem Körper. So reist er nach Cybertron und versucht, mit Hilfe der Predacons, den Heimatplaneten der Autobots und Decepticons zu zerstören.
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