新たな生物兵器として研究開発中の異種交配生物、通称“ピラニアシャーク”。ある事情で開発計画が頓挫し、多額の損失を出した開発会社はピラニアシャークを家庭用ペットとして売り出すことに。すると物珍しさに注文が殺到、大量のピラニアシャークたちが出荷されていく。しかし、奴らの生命力と繁殖力は半端なかった！ニューヨークの下水道に逃げ出したピラニアシャークが、街中の配水管をめぐりとてつもない勢いで繁殖し、殺戮マシーンと化す。この非常事態に米軍はニューヨークへの核攻撃を宣言。ピラニアシャーク唯一の弱点を発見した害虫駆除業者のジャクソンたち3人は、ニューヨークを救うために立ち上がる！
