Siamo nel 23° secolo. L'astronave della Federazione U.S.S. EnterpriseTM sta svolgendo delle esercitazioni di routine e l'Ammiraglio James T. Kirk (William Shatner) sembra rassegnato al fatto che quest' incarico potrebbe anche rappresentare l'ultima missione spaziale della sua carriera. Ma Khan è tornato. Aiutato da un equipaggio di uomini geneticamente superiori, Khan (Ricardo Montalban) - grande rinnegato della Terra del 20° secolo - dopo aver assalito la Stazione Spaziale Regula One e aver sottratto un dispositivo top secret chiamato Progetto Genesis, ha ora preso il controllo di una astronave della Federazione e sta preparando una trappola mortale per Kirk, suo nemico di vecchia data. La minaccia è la distruzione totale dell'universo. Con la partecipazione di Kirstie Alley (CheersTM), qui al suo sorprendente debutto cinematografico