La quête folle du gland maudit que Scratt poursuit depuis la nuit des temps a des conséquences sur le monde entier. Un cataclysme continental pousse Manny, Diego et Sid à se lancer dans leur plus grande aventure. Suite à cette agitation, Sid renoue avec son acariâtre Mémé et nos héros font face à une ménagerie hétéroclite de pirates marins déterminés à les empêcher de rentrer à la maison.