จักรพรรดิวัยสะออน เป็นการ์ตูนทีวีแอนิเมชัน ที่ออกอากาศในประเทศไทยทางช่องดิสนีย์ แชนเนล และสถานีโทรทัศน์กองทัพบกช่อง 7 ในรายการ ตูนดิสนีย์ ซึ่งเนื้อเรื่องในภาคนี้เป็นภาคต่อจากจักรพรรดิกลายพันธุ์ อัศจรรย์พันธุ์ต๊อง และเป็นซีรีส์แอนิเมชันเพื่อเปิดตัวภาพยนตร์เรื่องจักรพรรดิกลายพันธุ์ อัศจรรย์พันธุ์ต๊อง 2 ในปี พ.ศ. 2548 ซีรีส์เรื่องนี้มีจุดเด่นอยู่ที่ คูสโก้ ซึ่งต้องจบการศึกษาจาก Kuzco Academy เพื่อเป็นจักรพรรดิแห่งจักรวรรดิ Kuzconian อีสม่า อดีตที่ปรึกษาของเขาวางแผนที่จะก่อวินาศกรรมเขาเพื่อที่เธอจะได้เป็นจักรพรรดินีแทน เธอได้รับความช่วยเหลือจาก ครองท์ ลูกน้องของเธอในขณะที่ คูสโก้ ได้รับความช่วยเหลือจากชาวบ้าน อำมาตย์ และ เพื่อนนักเรียน มาลีน่า