easy Primer Design
50+
Downloads
Alle
info
Om denne app
easy Primer Design er et værktøj, der hjælper dig med at designe dine PCR-primere hvor som helst på en tidseffektiv måde: ved bænken, mens du venter på et eksperiment, på vej til eller fra arbejde eller på kontoret. Indsæt blot din nukleotidsekvens og specificer dine krav til at generere primersekvenser til din PCR-kloningsapplikation.
Funktioner:
-Brug indsæt-knappen for at indtaste din sekvens. Den indtastede CDS/sekvens indeholder tal, mellemrum, linjeskift, store eller små bogstaver? Det er lige meget! easy Primer Design fjerner tal, mellemrum og linjeskift og ændrer alt til store bogstaver!
-indtast din sekvens uden start- og stopkodon (og få en advarselsmeddelelse, hvis du har glemt at fjerne en af den) for at være fleksibel til primerdesign for plasmider med N-terminale eller C-terminale tags.
- vælg mellem mere end 20 forskellige restriktionsenzymsteder, Golden Gate-kloning understøttes via BsaI og BsbI, du kan endda gå ind i overhænget
-få advarselsmeddelelser, hvis dit valgte enzym ville skære din indtastede sekvens
-maksimal fleksibilitet via restriktionsenzymmuligheden 'andet', indtast dit restriktionsenzymsted, hvis det ikke er på listen - ikke-palindromiske sekvenser understøttes! Hvis dit indtastede begrænsningssted er til stede i din indtastede sekvens eller i dets omvendte komplement, får du en advarselsmeddelelse!
-få en advarselsmeddelelse for at undgå almindelige 'copy-paste'-fejl, hvis din indtastede sekvens indeholder et ufuldstændigt kodon!
-inkluder en KOZAK-sekvens i den fremadrettede primer, hvis du ønsker en
-Vælg om du har brug for et startkodon, og om du har brug for et stopkodon (alle 3 almindelige stopkodoner kan vælges)
-indtast en smeltetemperatur for dine primere, den beregnes ved hjælp af den saltjusterede smeltetemperatur
-indtast saltkoncentrationen (Na+)
-indtast en 5'-ende forlængelse for begge dine primere
-primere genereres til at slutte med G eller C
-smeltetemperatur, G/C-indhold og primerlængde vises
-gennemsigtig designproces! alle mellemtrin vises! Dine valgte muligheder vises under de endelige resultater!
-kopi-knap for at kopiere hele outputtet og sende det via e-mail til din stationære pc til de næste designtrin, eller gem det som en fil!
-Version 0.03-opdatering: ny funktion 'DeletionIn': hjælper dig med at designe primere til overlapsforlængelse PCR for at slette specifikke interne regioner fra en sekvens (f.eks. slet domæner)
-Version 0.045 opdatering: ny funktion 'Mutation' hjælper dig med at designe primere til overlap forlængelse PCR for at mutere en specifik kodon i din sekvens til at kode for en anden aminosyre
-Version 0.060-opdatering: ny funktion: 'DeletionNC' - hjælper dig med at designe primere til at slette N(5')- eller C(3')-terminale regioner fra din sekvens
-Version 0.080 opdatering: ny funktion: 'Insertion' - stryg til venstre i den øverste hovedmenu og find hjælp til at designe primere til overlap extension PCR for at indsætte en insert-sekvens i din sekvens
- Version 0.085 opdatering: ny funktion: 'Erstat' - stryg til venstre i den øverste hovedmenu for at få hjælp til at designe primere til overlap forlængelse PCR, der erstatter en intern region med en indtastet insert-sekvens
Bemærk venligst: easy Primer Design-mobilappen leverer ikke klar-til-brug primersekvenser, den understøtter dig kun under processen med primerdesign. Brugeren skal omhyggeligt validere rigtigheden af hver del af det genererede resultat og udføre alle andre nødvendige tests!
God kloning! - Håber det hjælper :)
Funktioner:
-Brug indsæt-knappen for at indtaste din sekvens. Den indtastede CDS/sekvens indeholder tal, mellemrum, linjeskift, store eller små bogstaver? Det er lige meget! easy Primer Design fjerner tal, mellemrum og linjeskift og ændrer alt til store bogstaver!
-indtast din sekvens uden start- og stopkodon (og få en advarselsmeddelelse, hvis du har glemt at fjerne en af den) for at være fleksibel til primerdesign for plasmider med N-terminale eller C-terminale tags.
- vælg mellem mere end 20 forskellige restriktionsenzymsteder, Golden Gate-kloning understøttes via BsaI og BsbI, du kan endda gå ind i overhænget
-få advarselsmeddelelser, hvis dit valgte enzym ville skære din indtastede sekvens
-maksimal fleksibilitet via restriktionsenzymmuligheden 'andet', indtast dit restriktionsenzymsted, hvis det ikke er på listen - ikke-palindromiske sekvenser understøttes! Hvis dit indtastede begrænsningssted er til stede i din indtastede sekvens eller i dets omvendte komplement, får du en advarselsmeddelelse!
-få en advarselsmeddelelse for at undgå almindelige 'copy-paste'-fejl, hvis din indtastede sekvens indeholder et ufuldstændigt kodon!
-inkluder en KOZAK-sekvens i den fremadrettede primer, hvis du ønsker en
-Vælg om du har brug for et startkodon, og om du har brug for et stopkodon (alle 3 almindelige stopkodoner kan vælges)
-indtast en smeltetemperatur for dine primere, den beregnes ved hjælp af den saltjusterede smeltetemperatur
-indtast saltkoncentrationen (Na+)
-indtast en 5'-ende forlængelse for begge dine primere
-primere genereres til at slutte med G eller C
-smeltetemperatur, G/C-indhold og primerlængde vises
-gennemsigtig designproces! alle mellemtrin vises! Dine valgte muligheder vises under de endelige resultater!
-kopi-knap for at kopiere hele outputtet og sende det via e-mail til din stationære pc til de næste designtrin, eller gem det som en fil!
-Version 0.03-opdatering: ny funktion 'DeletionIn': hjælper dig med at designe primere til overlapsforlængelse PCR for at slette specifikke interne regioner fra en sekvens (f.eks. slet domæner)
-Version 0.045 opdatering: ny funktion 'Mutation' hjælper dig med at designe primere til overlap forlængelse PCR for at mutere en specifik kodon i din sekvens til at kode for en anden aminosyre
-Version 0.060-opdatering: ny funktion: 'DeletionNC' - hjælper dig med at designe primere til at slette N(5')- eller C(3')-terminale regioner fra din sekvens
-Version 0.080 opdatering: ny funktion: 'Insertion' - stryg til venstre i den øverste hovedmenu og find hjælp til at designe primere til overlap extension PCR for at indsætte en insert-sekvens i din sekvens
- Version 0.085 opdatering: ny funktion: 'Erstat' - stryg til venstre i den øverste hovedmenu for at få hjælp til at designe primere til overlap forlængelse PCR, der erstatter en intern region med en indtastet insert-sekvens
Bemærk venligst: easy Primer Design-mobilappen leverer ikke klar-til-brug primersekvenser, den understøtter dig kun under processen med primerdesign. Brugeren skal omhyggeligt validere rigtigheden af hver del af det genererede resultat og udføre alle andre nødvendige tests!
God kloning! - Håber det hjælper :)
Opdateret
For at du kan beskytte dine data, er det vigtigt at sætte sig ind i, hvordan udviklere indsamler og deler disse data. Databeskyttelses- og sikkerhedsprocedurer kan variere afhængigt af din brug, din region og din alder. Udvikleren har leveret disse oplysninger og kan løbende opdatere dem.
Der deles ikke data med tredjeparter
Få flere oplysninger om, hvordan udviklere angiver, at de deler data
Der blev ikke indsamlet data
Få flere oplysninger om, hvordan udviklere angiver, at de indsamler data
Nyheder
-New Feature: Replace - swipe left in the top main menu to get help for designing primers for overlap extension PCR, that replace an internal region with an entered insert-sequence
-help section updated
-help section updated
Support til app
Om udvikleren
Nikolas Furthmann
easyprimerdesign@gmail.com
Germany
undefined
