Phantom Dungeon on vuoropohjainen taistelupeli, jossa on satunnaisia vankityrmiä ja pikselitaidegrafiikkaa. Jokainen vankityrmä on erilainen, tutki vankityrmää ja löydä erilaisia huoneita, jotka kullakin tasolla on sinulle, samalla kun tutkit vankityrmää, voit värvätä liittolaisia muodostamaan joukkueen. Jos pidät liittolaisista, voit kokeilla onneasi ja vaihtaa sen toiseen, on myös aarteita sisältäviä huoneita, joissa saat esineen, joka lisää hahmosi ominaisuuksia, etene vankityrmän jokaisen tason läpi, löydä pomon huoneeseen ja voita se siirtyäksesi seuraavalle tasolle portaiden kautta.
Taisteluissa ohjaat päähenkilöä, joka voi käyttää kahta asetta, mailaa ja pistoolia, liittoutuneet hahmot toimivat yksin, jokaisella hahmolla on toimintapalkki, joka täytettynä hahmot toimivat, jokaisella hahmolla on 4 attribuuttia, HP, Attack , Puolustus ja ActionVelocity ja myös erikoiskyky perushyökkäyksen lisäksi löytää jokaisen hahmon kyvyt ja muodostaa pysäyttämättömän ryhmän.