Епидемиологија биљних болести је проучавање болести биљних популација. Слично као и болести људи и других животиња, биљне болести настају услед патогена попут бактерија, вируса, гљивица, оомицета, нематода, фитоплазми, протозоа и паразитских биљака. Епидемиолози биљних болести теже ка разумевању узрока и последица болести и развијају стратегије за интервенцију у ситуацијама када може доћи до губитка усева. Уобичајено успешна интервенција довешће до довољно ниског нивоа болести да буде прихватљива, у зависности од вредности усева.
На епидемиологију биљних болести често се гледа из мултидисциплинарног приступа, који захтева биолошку, статистичку, агрономску и еколошку перспективу. Биологија је неопходна за разумевање патогена и његовог животног циклуса. Такође је неопходно за разумевање физиологије усева и како патоген негативно утиче на њега. Агрономске праксе често утичу на појаву болести у добру или злу. Еколошки утицаји су бројни. Нативне биљне врсте могу послужити као резервоари за патогене који узрокују болести у усевима. Статистички модели се често примењују како би се сумирао и описао сложеност епидемиологије биљних болести, тако да се процеси болести могу лакше разумети. На пример, поређење између образаца напредовања болести за различите болести, сорте, стратегије управљања или окружења може помоћи у одређивању како се биљним болестима може најбоље управљати. Политика може утицати на појаву болести, кроз акције попут ограничења увоза из извора где се болест јавља.