SeedCounter
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Acerca de esta app
La aplicación calcula el número y tamaño de granos en una hoja de papel de varios tamaños (A5, A4, A3).
Utilizando:
1. Coloque una hoja de papel blanca de tamaño estándar sobre una mesa oscura.
2. Coloque los granos en un papel.
3. Asegúrese de que haya suficiente iluminación en la superficie de la hoja.
4. Abra la aplicación en su dispositivo móvil.
5. Apunte la cámara de su dispositivo móvil a la hoja perpendicular a la superficie de la hoja, de modo que la hoja esté completamente en el marco con un ligero agarre de la superficie oscura de la mesa en los bordes.
6. Toque la pantalla, espere unos segundos hasta que se capture la imagen. Cuando termine, se abrirá una imagen con los granos seleccionados y su número.
7. Toque la pantalla para abrir el menú de guardar datos.
8. Introduzca una etiqueta para los datos y elija una de las siguientes opciones: guardar y continuar, guardar y salir al menú principal o cerrar el menú.
Recomendaciones para la obtención de imágenes:
1. Coloque la hoja de papel sobre una superficie predominantemente oscura. Una superficie clara se mezclará con la hoja de papel, lo que dificultará su reconocimiento.
2. Evite el deslumbramiento de la superficie. Esto puede interferir con el reconocimiento de la hoja.
3. Asegúrese de que la hoja de papel esté bien iluminada y sin sombras. Dado que las sombras a menudo caen del usuario, sus manos y el dispositivo en sí, es mejor tener la fuente de luz frente al usuario. En este caso, es necesario que la fuente de luz sea lo más perpendicular posible a la superficie de la hoja. Las fuentes de luz de alto ángulo proyectarán sombras sobre los granos, lo que puede interferir con el reconocimiento.
4. Coloque la hoja de papel de modo que su relación de aspecto coincida con la relación de ancho a alto de la cámara del dispositivo.
5. No mueva la cámara demasiado lejos de la hoja.
6. No esparza granos demasiado cerca del borde de la hoja.
7. Evite que se acumulen escombros en la hoja. Las partículas de escombros se pueden reconocer erróneamente como granos.
8. Evite entrar en el marco de objetos extraños.
Características de la forma de la semilla estimadas por la aplicación SeedCounter
El tamaño de la semilla se estima ajustando una elipse con la función "fitEllipse" de la biblioteca OpenCV
'Longitud' calcula la longitud de la semilla. Es la longitud del eje mayor de la elipse ajustada
'Width' estima el ancho de la semilla. Es la longitud del eje menor de la elipse ajustada
"Área" es el área proyectada de la semilla
"Índice de circularidad": es una medida de la similitud de un contorno con un círculo. La circularidad de un círculo es 1, el valor disminuye cuando el contorno se desvía de la forma del círculo
'Redondez' es la relación entre el área del contorno de la semilla y el área del círculo con un diámetro igual al eje de rotación del contorno (eje mayor)
'Solidez' es la relación entre el área del contorno y el área de su casco convexo.
La 'rugosidad' es la relación entre el perímetro del contorno y el perímetro convexo del casco.
Estos índices se describen con más detalle en el artículo:
Cervantes E., Martín J. J., Saadaoui E. Métodos actualizados para el análisis de la forma de las semillas // Scientifica. - 2016 .-- T. 2016.
'Rci / Rcc' es la relación entre el radio del círculo máximo inscrito (Rci) y el radio del círculo mínimo circunscrito (Rcc).
'Rci / Rce' es la relación entre el radio del círculo máximo inscrito (Rci) y el radio del círculo con un área equivalente al contorno del área de la semilla (Rce).
"AIX" y "AIY" son las coordenadas X e Y del centro de la elipse ajustada, respectivamente.
"CMX" y "CMY" son las coordenadas X e Y del centro de masa del contorno de la semilla, respectivamente.
'D_AI_CM' es la distancia desde el centro de masa hasta el centro de la elipse ajustada.
Si utiliza este software, cite la publicación que lo describe:
Komyshev E., Genaev M., Afonnikov D. (2017) Evaluación de SeedCounter, una aplicación móvil para el fenotipado de granos. Frontiers in Plant Science, 7, 1990; DOI: 10.3389 / fpls.2016.01990.
Utilizando:
1. Coloque una hoja de papel blanca de tamaño estándar sobre una mesa oscura.
2. Coloque los granos en un papel.
3. Asegúrese de que haya suficiente iluminación en la superficie de la hoja.
4. Abra la aplicación en su dispositivo móvil.
5. Apunte la cámara de su dispositivo móvil a la hoja perpendicular a la superficie de la hoja, de modo que la hoja esté completamente en el marco con un ligero agarre de la superficie oscura de la mesa en los bordes.
6. Toque la pantalla, espere unos segundos hasta que se capture la imagen. Cuando termine, se abrirá una imagen con los granos seleccionados y su número.
7. Toque la pantalla para abrir el menú de guardar datos.
8. Introduzca una etiqueta para los datos y elija una de las siguientes opciones: guardar y continuar, guardar y salir al menú principal o cerrar el menú.
Recomendaciones para la obtención de imágenes:
1. Coloque la hoja de papel sobre una superficie predominantemente oscura. Una superficie clara se mezclará con la hoja de papel, lo que dificultará su reconocimiento.
2. Evite el deslumbramiento de la superficie. Esto puede interferir con el reconocimiento de la hoja.
3. Asegúrese de que la hoja de papel esté bien iluminada y sin sombras. Dado que las sombras a menudo caen del usuario, sus manos y el dispositivo en sí, es mejor tener la fuente de luz frente al usuario. En este caso, es necesario que la fuente de luz sea lo más perpendicular posible a la superficie de la hoja. Las fuentes de luz de alto ángulo proyectarán sombras sobre los granos, lo que puede interferir con el reconocimiento.
4. Coloque la hoja de papel de modo que su relación de aspecto coincida con la relación de ancho a alto de la cámara del dispositivo.
5. No mueva la cámara demasiado lejos de la hoja.
6. No esparza granos demasiado cerca del borde de la hoja.
7. Evite que se acumulen escombros en la hoja. Las partículas de escombros se pueden reconocer erróneamente como granos.
8. Evite entrar en el marco de objetos extraños.
Características de la forma de la semilla estimadas por la aplicación SeedCounter
El tamaño de la semilla se estima ajustando una elipse con la función "fitEllipse" de la biblioteca OpenCV
'Longitud' calcula la longitud de la semilla. Es la longitud del eje mayor de la elipse ajustada
'Width' estima el ancho de la semilla. Es la longitud del eje menor de la elipse ajustada
"Área" es el área proyectada de la semilla
"Índice de circularidad": es una medida de la similitud de un contorno con un círculo. La circularidad de un círculo es 1, el valor disminuye cuando el contorno se desvía de la forma del círculo
'Redondez' es la relación entre el área del contorno de la semilla y el área del círculo con un diámetro igual al eje de rotación del contorno (eje mayor)
'Solidez' es la relación entre el área del contorno y el área de su casco convexo.
La 'rugosidad' es la relación entre el perímetro del contorno y el perímetro convexo del casco.
Estos índices se describen con más detalle en el artículo:
Cervantes E., Martín J. J., Saadaoui E. Métodos actualizados para el análisis de la forma de las semillas // Scientifica. - 2016 .-- T. 2016.
'Rci / Rcc' es la relación entre el radio del círculo máximo inscrito (Rci) y el radio del círculo mínimo circunscrito (Rcc).
'Rci / Rce' es la relación entre el radio del círculo máximo inscrito (Rci) y el radio del círculo con un área equivalente al contorno del área de la semilla (Rce).
"AIX" y "AIY" son las coordenadas X e Y del centro de la elipse ajustada, respectivamente.
"CMX" y "CMY" son las coordenadas X e Y del centro de masa del contorno de la semilla, respectivamente.
'D_AI_CM' es la distancia desde el centro de masa hasta el centro de la elipse ajustada.
Si utiliza este software, cite la publicación que lo describe:
Komyshev E., Genaev M., Afonnikov D. (2017) Evaluación de SeedCounter, una aplicación móvil para el fenotipado de granos. Frontiers in Plant Science, 7, 1990; DOI: 10.3389 / fpls.2016.01990.
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