Приложение считает количество и размер зерен на листе бумаги различных форматов (A5, A4, A3).
Использование:
1. Расположите белый лист бумаги стандартного формата на темной поверхности стола.
2. Поместите зерна на лист бумаги.
3. Убедитесь в наличии достаточного уровня освещения поверхности листа.
4. Откройте приложение на мобильном устройстве.
5. Наведите камеру мобильного устройства на лист перпендикулярно поверхности листа, так чтобы лист полностью попадал в кадр с небольшим захватом темной поверхности стола по краям.
6. Нажмите на экран, подождите несколько секунд пока захватывается изображение. По окончании откроется изображение с выделенными зернами и их количеством.
7. Нажмите на экран, чтобы открыть меню сохранения данных.
8. Введите метку для данных и выберите одно из следующих действий: сохранить и продолжить, сохранить и выйти в главное меню или закрыть меню.

Рекомендации по получению изображений:
1. Располагайте лист бумаги на преимущественно темной поверхности. Светлая поверхность будет сливаться с листом бумаги, что помешает его распознаванию.
2. Избегайте бликов на поверхности. Это может помешать распознаванию листа.
3. Убедитесь, что лист бумаги хорошо освещен и на него не падают тени. Так как тени часто падают от пользователя, его рук, а также самого устройства, лучше, чтобы источник света располагался напротив пользователя. При этом необходимо чтобы источник света был максимально перпендикулярен поверхности листа, на сколько это возможно. Источники света, находящиеся под большим углом, будут давать тень от зерен, что может помешать их распознаванию.
4. Располагайте лист бумаги так, чтобы соотношения его сторон соответствовали соотношению ширины и высоты кадра камеры устройства.
5. Не отдаляйте камеру слишком далеко от листа.
6. Не рассыпайте зерна слишком близко к краю листа.
7. Избегайте попадания мусора на лист. Частицы мусора могут быть ошибочно распознаны как зерна.
8. Избегайте попадания в кадр посторонних предметов.

Seed shape characteristics estimated by SeedCounter app

Seed size is estimated by fitting an ellipse with the "fitEllipse" function of OpenCV library
‘Length’ estimates the seed length. It is the length of the major axis of fitted ellipse
‘Width’ estimates the seed width. It is the length of the minor axis of fitted ellipse
‘Area’ is the projected area of the seed

‘Circularity Index’ - It is a measure of the similarity of a contour with a circle. The circularity of a circle is 1, the value decreases when the contour deviates from the circle shape
‘Roundness’ is the ratio of seed contour area to the area of the circle with a diameter equal to the rotation axis of the contour (major axis)
‘Solidity’ is the ratio of contour area to the area of its convex hull.
‘Rugosity’ is the ratio of contour perimeter to convex hull perimeter.
These indexes are described in more detail in the article:
Cervantes E., Martín J. J., Saadaoui E. Updated methods for seed shape analysis //Scientifica. – 2016. – Т. 2016.

‘Rci/Rcc’ is is the ratio of the radius of the maximum inscribed circle (Rci) to the radius of the minimum circumscribed circle (Rcc).
‘Rci/Rce’ is the ratio of the radius of the maximum inscribed circle (Rci) to the radius of the circle with area equivalent to area contour of the seed (Rce).

‘AIX’ and ‘AIY’ is the X and Y coordinates of the center of the fitted ellipse respectively.
‘CMX’ and ‘CMY’ is the X and Y coordinate of the mass center of the seed contour respectively.

‘D_AI_CM’ is the distance from mass center to the center of the fitted ellipse.

If you use this software, please cite the publication that describe it:
Komyshev E., Genaev M., Afonnikov D. (2017) Evaluation of the SeedCounter, a mobile application for grain phenotyping. Frontiers in plant science, 7, 1990; DOI: 10.3389/fpls.2016.01990.