İstanbul’un Fatih semtinde doğdu (1951). İstanbul İmam-Hatip Okulu ve İstanbul Mecidiyeköy Lisesi’nden (1969, 1970) mezun oldu. İstanbul Yüksek İslâm Enstitüsü’nü (Marmara Üniversitesi İlâhiyat Fakültesi) bitirdi (1973). Lise diplomasıyla kaydolduğu İstanbul Üniversitesi Hukuk Fakültesi’ne iki yıl devam etti.
Memuriyet hayatına Bitlis İmam-Hatip Lisesi’nde meslek dersleri öğretmeni olarak başladı. Bu okulda müdür yardımcısı olarak da çalıştı. Daha sonra kurum değiştirerek Diyanet İşleri Başkanlığı’na geçti. Başkanlığın Ankara Eğitim Merkezi’nde ve İstanbul Haseki Eğitim Merkezi’nde kuruluş aşamasında Müdür Yardımcısı olarak görev yaptı.
1977 yılında Kayseri Yüksek İslâm Enstitüsü’nde (Erciyes Üniversitesi İlâhiyat Fakültesi) “Kelâm ve İslâm Düşüncesi Asistanı” olarak başladığı akademik hayatını, 1985 yılında Marmara Üniversitesi İlâhiyat Fakültesi’ne naklen atanarak sürdürdü. Bu fakültede üç dönem dekan yardımcılığı görevinde bulundu. Bu sırada Fakülte Kurulu ve Yönetim Kurulu üyeliği de yaptı. Üniversite Senatosu’nda İlâhiyat Fakültesi’ni temsil etti.
1984 yılında Uludağ Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü’nde Kelâm Anabilim Dalı’nda “doktor”; 1990 yılında “doçent”; 1996 yılında “profesör” ünvanını aldı.
Kıbrıs Lefkoşa’da kurulan Yakın Doğu Üniversitesi İlâhiyat Fakültesi’nde üç yıl süreyle misafir öğretim üyesi olarak dersler veren Metin YURDAGÜR, Marmara Üniversitesi İlâhiyat Fakültesi’ndeki öğretim üyeliğinden 2018 yılında yaş haddinden emekli oldu. Hâlen İstanbul Sabahattin Zâim Üniversitesi İslâmî İlimler Fakültesi’nde ve Sosyal Bilimler Enstitüsü’nde kendi alanında lisans ve lisansüstü dersler vermekte; Bayburt Üniversitesi İlâhiyat Fakültesi’nde de çevrimiçi yöntemiyle alanıyla ilgili lisans derslerini yürütmektedir. 1985 yılında TDV İslâm Ansiklopedisi’nin neşrinden önce başladığı İSAM bünyesindeki telif ve redaksiyon çalışmalarıyla kelâm alanındaki araştırmalarına devam etmektedir.
TDV İslâm Ansiklopedisi’nde neşredilen sahasıyla ilgili birçok maddesi; çeşitli periyodiklerde yayımlanan makaleleri yanında, Allah’ın Sıfatları (İstanbul 1984); Bibliyografik Bir Kelâm Tarihi Denemesi (İstanbul 1989); İslâm Düşüncesinde Fetret Kavramı (İstanbul 1996, İlâveli 2. Baskı İstanbul 1998); Âyet ve Hadislerde Esmâ-i Hüsnâ: Allah’ın İsimleri-Literatür ve Şerh (İstanbul 1996, 4. Baskı İstanbul 2006); Mâverâünnehir’den Osmanlı Coğrafyasına Ünlü Türk Kelâmcıları (İstanbul 2017, 2. Baskı İstanbul 2019); Kelâm Tarihi Ekoller – Şahıslar – Eserler (İstanbul 2017, 4. Baskı İstanbul 2019) adlı yayımlanmış kitapları da bulunmaktadır.