Die Kultivierung der AGE1.HN.PAR- und AGE1.HN.AAT-Zelllinien wurde im
Rahmen dieser Arbeit zunächst etabliert und optimiert. Für den
systembiologischen Ansatz im SysLogics-Projekt war ein Scale-up der
Kultivierung bis zum 20 L-Edelstahlreaktor notwendig, da der gesamte
Kulturverlauf mit allen zur Verfügung stehenden Omics-Techniken
untersucht werden sollte.
Als (prozessübliche) physiologische Störungen wurden weiterhin
Temperaturshifts zu niedrigeren Temperaturen (milde Hypothermie)
eingesetzt, die direkte Auswirkungen z. B. auf viable Zelldichte und
Substratkonzentrationen hatten.
Aus den generierten Proben wurden weiterhin die Mitochondrien isoliert,
da in diesen Organellen ein Hauptbestandteil des Zentralstoffwechsels
stattfindet, der Citratzyklus. Mittels 2D-DIGE Experimenten konnten
Unterschiede in der Proteinexpression dargestellt werden, die mit der
erstellten 2D-Proteomkarte für die mitochondriale Fraktion zugeordnet
werden konnten.
Schließlich wurden die generierten Daten statistisch ausgewertet und zum
Teil mit den aus den gleichen Prozessen berechneten Fluss-Daten
korreliert. Es ergibt sich ein interessanter Blick auf regulierte und
nicht-regulierte Stoffwechselwege der hier näher untersuchten
Zelllinien.