Cuando un submarino nuclear se hunde misteriosamente en un punto remoto del fondo oceánico, la Marina de los Estados Unidos envía a un equipo de buzos a intentar un recate en un prototipo de plataforma petrolífera submarina. Cuando un huracán corta las comunicaciones entre la superficie y las profundidades, el equipo comienza a ver pruebas de una inteligencia extraña y posiblemente alienígena. Mientras el jefe Bud Brigman (Ed Harris) discute con su exmujer y jefa (Mary Elizabeth Mastrantonio), el comandante de la Marina comienza a volverse paranoico sobre la misteriosa vida alienígena y amenaza con usar un arma nuclear recuperada para destruirlo todo.