.hack//Roots es un anime de 26 episodios, animada por el estudio Bee Train, que fue emitida en TV Tokyo y empezó a emitirse el 11 de noviembre de 2006 por Cartoon Network aún está siendo emitida.
En .hack//Roots se narra la historia de Haseo, un Adept Rouge que acaba de comenzar a jugar al MMORPG The World R:2, que se verá envuelto en una serie de acontecimientos que implicarán un gran cambio tanto en el como en los que le rodean.